认知相关基因的生化通路与蛋白质互作网络分析
胡莹1
赵晓宇2
杨海波3
戴隆耀2
贾蕾2
1.教育部人文社会科学重点研究基地天津师范大学心理与行为研究院,天津300074;天津师范大学心理学部,天津3003872.天津师范大学心理学部,天津3003873.教育部人文社会科学重点研究基地天津师范大学心理与行为研究院,天津300074;天津师范大学心理学部,天津300387;国民心理健康评估与促进协同创新中心,天津300074
摘要：目的 用生物信息学的方法揭示认知相关基因所调控的生物过程及通路,构建认知基因的特异蛋白网络,并挖掘其主要功能.方法 在GO、phenopedia、GLAD4U 3个数据库中,收集认知相关的基因,进行基因本体分析、通路分析及通路串话分析;从人类蛋白互作网络中提取认知相关特异蛋白网络,并通过聚类分析找出重要功能模块.结果 明确了126个认知相关基因,这些基因主要参与学习或记忆、神经发育等生物过程;多条与神经突触发育、信号转导、成瘾相关的通路参与认知过程,且各个通路之间存在紧密的串话作用.认知相关基因之间存在显著的互相作用关系(P＜10-16),相比背景基因具有更高节点度(P=1.39×10-4)以及介数中心性(P=2.07×10-5);聚类分析挖掘出胺转运调节、胆碱能突触传递和学习等重要功能模块.结论 认知是一个非常复杂的过程,涉及多个具有关键功能的基因,如HTR3A、CHRNA6、BDNF等,基因间通过紧密互相作用,调控多个生物过程及通路,包括胆碱能突触,多巴胺能突触、血清素能突触等,这些通路彼此协同发挥功能.
关键词：认知相关基因功能富集分析生化通路蛋白质互作网络
分类号：R857.3(航空航天医学)
资助基金：天津市哲学社会科学规划项目(TJJX15-002)
论文发表日期：2020-04-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 166-174 )
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