基于宏基因组学的海带降解菌群微生物多样性及其褐藻多糖降解酶系分析
周敏1
王海英2
冷凯良3
苗钧魁3
刘小芳3
赵静2
高华4
1.青岛大学药学院,山东青岛266021;中国水产科学研究院黄海水产研究所、农业农村部极地渔业重点实验室,山东青岛2660712.中国水产科学研究院黄海水产研究所、农业农村部极地渔业重点实验室,山东青岛,2660713.中国水产科学研究院黄海水产研究所、农业农村部极地渔业重点实验室,山东青岛266071;海洋国家实验室海洋药物与生物制品功能实验室,山东青岛2662374.青岛大学药学院,山东青岛,266021
摘要：为系统探讨一组高效海带降解菌群的微生物多样性及其褐藻多糖降解酶系,本实验利用高通量测序技术对该菌群进行组学分析.结果表明,共获得36552330条reads,预测得到105145条基因序列,比对显示此高效海带降解菌群中有75.41％的厚壁菌门(Firmicutes)细菌,优势菌属包括Lachno-clostridium、芽孢杆菌属(Bacillus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、解硫胺素芽孢杆菌属(Aneurinibacil-lus)、短芽孢杆菌属(Brevibacillus).数据显示有4526个基因编码蛋白质具有海带多糖降解相关酶活性,其中糖苷水解酶(GH)基因数量最多(1520),碳水化合物结合模块(CBM) (764)、碳水化合物酯酶(CE)基因(706)和糖基转移酶(GT) (693)数量次之,多糖裂合酶(PL)基因(107)和辅助氧化还原酶(AA)基因(126)数量较少.在不同的GH基因家族,归属于GH109、GH13、GH18、GH43家族的基因较多.此外还发现了少量的纤维小体组分蛋白基因.本研究发现海带降解菌群中有丰富的褐藻胶裂解酶,纤维素酶,果胶酶,淀粉酶酶系产酶菌,为进一步开发人工高效褐藻降解菌群及褐藻多糖降解酶提供参考.
关键词：海带海带降解菌群宏基因组学菌群多样性多糖降解酶
分类号：Q939.9(应用微生物学)
资助基金：青岛市市南区科技发展项目(2016-3-005-ZH)中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2017RC-YJ01)青岛市民生科技计划(17-3-3-59-nsh)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 109-117 )
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