基于高通量测序的长蛸不同组织转录组比较分析
王宇1
侯纯强1
栾凯2
汪笑宇2
郑德斌2
1.天津渤海水产研究所;天津市海洋牧场技术工程中心,天津经济技术开发区,3004572.天津渤海水产研究所
摘要：为满足标记辅助育种的要求,利用高通量PE150测序技术首次开展了长蛸五个不同组织的转录组测序,并用Newbler等软件进行转录本的组装以及转录本的功能注释.结果 表明:共获得了共获得268227814条reads,总碱基数为273451253bp,共得到个基因,平均基因长度为795bp,N50为1236bp,最大基因长度为18893bp,最小的基因长度为201bp,结果有82295条unigene注释到GO,32725个unigene注释到KEGG数据库,52035个unigene注释到SwissProt数据库,共鉴定出57685个具有完整的ORF的全长cDNA序列.鉴定出136009个微卫星和138417个SNP位点,这为深入开展长蛸分子标记辅助的遗传育种、种群遗传学和资源评估等研究提供了丰富的标记资源.
关键词：长蛸无参转录组不同组织
分类号：S917.4(水产基础科学)
资助基金：天津市农业科技成果转化与推广项目(201304150)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 125-134 )
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