基于线粒体Cytb基因的龙头鱼及其近缘物种分子系统发育研究
杨天燕
蒋艳琳
郭易佳
朱岚倩
林彦均
郑亦佳
高天翔
1.浙江海洋大学水产学院,浙江舟山3160222.浙江海洋大学水产学院,浙江舟山3160223.浙江海洋大学水产学院,浙江舟山3160224.浙江海洋大学水产学院,浙江舟山3160225.浙江海洋大学水产学院,浙江舟山3160226.浙江海洋大学水产学院,浙江舟山3160227.浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022
摘要:测定了长度为1092bp的龙头鱼(Harpadonnehereus)线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列片段,并分析探讨了龙头鱼及其近缘种分子系统发育关系.研究结果表明,4种碱基平均含量分别为29.9%(胸腺嘧啶T)、31.2%(胞嘧啶C)、22.9%(腺嘌呤A)、16%(鸟嘌呤G).碱基替换多发生在密码子第三位点,且分布呈明显偏倚现象,约占总变异的70.1%.碱基转换数略高于颠换数,二者比值为2.03,碱基替代饱和度检验显示碱基突变率尚未达到饱和.以哲罗鱼和河鳟为外群构建邻接系统发育树分成两支,灯笼鱼科鱼类聚为一支,龙头鱼属和蛇鲻属亲缘关系较近.基于非同义突变率(Ka)和同义突变率(Ks)的选择压力分析结果表明,灯笼鱼目鱼类经历了正选择,这与其在长期进化过程中适应深海栖息环境有关,而龙头鱼属和蛇鲻属不同位点似然比率检验未检测到正选择位点,推测与这两种类群的鱼类分布的水深较浅有关.
关键词:龙头鱼灯笼鱼目Cytb基因系统发育选择压力
分类号:Q951+.3(动物演化与发展)
资助基金:国家自然科学基金(41776171)国家级大学生创新创业训练计划项目(201810340010)人才引进科研基金(2016-2017)
论文发表日期:2020-12-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 77-85 )
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海洋湖沼通报

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ISSN:1003-6482
年,卷(期):2020,(6)