海洋微拟球藻对共培养三角褐指藻的分子生理学响应机制
孙诗阳1
张忠义2
刘航2
郭栗2
杨官品3
1.中国海洋大学水产学院,山东青岛2660032.中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛2660033.中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室,山东青岛266003;中国海洋大学进化与海洋生物多样性研究所,山东青岛266003
摘要：本研究运用多物种混合转录组测序(msRNA-seq)法分析了对数生长期海洋微拟球藻响应相同细胞数指数末期三角褐指藻共培养的生理机制.两种藻的细胞总数在8 d内基本不变.三角褐指藻转录组结果中存在与生长有关的基因的表达,且难以与响应共培养的生理过程区分.因此,我们只分析微拟球藻响应共培养的转录组变化及其揭示的生理学机制.分析发现在共培养的初始24 h内共有8 235个基因表达,其中,809个为显著差异表达基因,351个下调表达,458个上调表达.这些差异基因被富集到7条KEGG通路中.其中,在DNA复制和同源重组通路上所富集的基因呈下调表达,而在氨基和核苷酸糖代谢通路、Focal adhesion、PI3 K-Akt、cAMP、ErbB信号通路上所富集的基因呈上调表达.结果表明海洋微拟球藻响应三角褐指藻共培养时发生了一系列生理学变化.这是应用多物种混合转录组测序分析微藻间互作的初步尝试,建立的方法也适用微藻和其它微生物的互作机制研究.
关键词：微藻共培养交互RNA-seq混合物种RNA-seq
分类号：Q175(水生生物学)
资助基金：国家重点研发计划(2018YFD0900305)国家重点研发计划(2018YFD0901506)山东省支持青岛海洋科学与技术试点国家实验室专项(2018SDKJ0406-3)中央高校基本科研业务费专项(201762017)
论文发表日期：2022-10-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 40-47 )
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