多个通用引物的宏条形码技术在滇池鱼类多样性研究中的应用
孟涵1
徐杉2
吕嘉诚1
赵凯嵩1
赵峥2
林渊源2
1.昆明学院农学与生命科学学院,云南 昆明 6502142.昆明学院昆明滇池(湖泊)污染防治合作研究中心,云南省河流湖泊生态健康评估与恢复重点实验室,昆明市河流湖泊生态健康评估与恢复院士工作站,云南 昆明 650214
摘要：通用引物的选择对环境DNA(Environmental DNA,eDNA)宏条形码技术监测鱼类多样性至关重要.本研究比较了 6对通用引物(Teleo、Meta、CY45M、1634M、MiFish、FishCB)对滇池水体eDNA的扩增效果,结果显示1634M、Meta、Teleo均能扩增出明亮清晰且单一的条带,适用于后续高通量测序分析.基于1634M、Meta、Teleo对滇池枯水期和丰水期eDNA样本进行高通量测序分析共注释到8目13科36属37种鱼类,包括滇池常见鱼类如泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)、鲫(Carassius auratus)、黄鳝(Monopterus albus)、鲤(Cyprinus carpio)、麦穗鱼(Pseudorasbora parva)等及濒危珍稀鱼类滇池金线鲃(Sinocyclocheilus grahami).1634M、Meta、Teleo分别注释到24、9、10种鱼类,且三种引物注释到的鱼类物种组成存在显著差异,滇池金线鲃、红鳍原鲌(Cultrichthys erythropterus)、草鱼(Cteno pha-ryngodon idella)等33种鱼类为某一引物所特异注释,而三种引物均注释到的鱼类为间下鱵(Hyporh-amphus intermedius)和鲤;1634M 和 Meta 均注释到的鱼类为真吻虾虎鱼(Rhinogobius similis);Teleo和Meta均注释到的鱼类为鲫.三种引物监测结果均能表征滇池鱼类多样性的季节差异,且丰水期各采样点鱼类物种组成差异较枯水期小.综上所述1634M、Meta、Teleo均可作为eDNA宏条形码技术监测滇池鱼类多样性的通用引物,但1634M检出的鱼类种类最多,可能较Meta和Teleo更适合于滇池鱼类监测,组合多个通用引物可提高鱼类物种组成覆盖率,多样性监测效果更佳.
关键词：环境DNA通用引物鱼类物种组成滇池
分类号：S917.4(水产基础科学)
资助基金：云南省科技厅基础研究计划(202201AU070026)云南省教育厅科学研究基金项目(2022J0646)云南省科技厅联合专项重点资助项目(202001BA070001-130)国家自然科学基金(NSFC;U1902202)
论文发表日期：2025-12-30
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 147-156 )
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