两种方法分离免疫细胞用于高通量测序TCR组库分析的比较
黄红艳
王小利
周心娜
张彦斌
李莎
任军
1.首都医科大学附属北京世纪坛医院肿瘤内科,北京,1000382.首都医科大学附属北京世纪坛医院肿瘤内科,北京,1000383.首都医科大学附属北京世纪坛医院肿瘤内科,北京,1000384.首都医科大学附属北京世纪坛医院肿瘤内科,北京,1000385.首都医科大学附属北京世纪坛医院肿瘤内科,北京,1000386.首都医科大学附属北京世纪坛医院肿瘤内科,北京,100038
摘要：目的 探讨两种方法分离免疫细胞进行高通量T细胞表面的T细胞变体(TCR),组库分析的区别及可行性.方法 分别采用免疫磁珠分选纯化CD3阳性T细胞和Ficoll-Paque梯度离心法分离外周血淋巴细胞的方法制备TCR测序所需样品各1例,提取DNA后多重聚合酶链式反应(PCR)扩增CDR3区域,将扩增得到的PCR产物纯化后构建免疫组库,进行高通量测序及生物信息学分析.结果 两种方法获得的免疫细胞提取DNA后均能够满足TCR免疫组库建库需要,高通量测序结果显示互补决定簇3 (CDR3)区域长度呈高斯分布,来自健康志愿者的TCR具有丰富多样性,肿瘤患者TCR多样性呈寡克隆分布.结论 纯化的T细胞或者直接分离得到的淋巴细胞均可用于免疫组库构建及后续TCR CDR3受体库高通量测序分析,TCR CDR3多样性可能直接反应机体免疫状态.
关键词：T细胞受体高通量测序互补决定簇3
分类号：R392(医学免疫学)
资助基金：国家自然科学基金面上项目(C81172534)
论文发表日期：2015-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 215-218 )
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