mNGS在下呼吸道感染患者肺泡灌洗液中革兰氏阴性菌的诊断效能分析
翟翠娟
曹惠芳
200000 上海静安区中心医院呼吸及危重症医学科
摘要：目的 探究宏基因组测序技术(mNGS)在院内下呼吸道感染(LRTIs)患者肺泡灌洗液(BALF)中革兰氏阴性菌诊断价值.方法 回顾性分析2020年3月～2022年2月期间上海静安区中心医院收治的148例行肺泡灌洗的院内LRTIs患者的临床资料,均行BALF样本mNGS检测、传统病原微生物培养及药敏试验,以传统病原微生物培养为"金标准",采用Kappa 一致性分析mNGS检测对院内LRTIs患者BALF中革兰氏阴性菌的诊断效能,依据革兰氏阴性菌诊断结果将研究对象分为阴性组和阳性组,比较两组基线资料及实验室血液学检测指标结果,记录检出菌株最多菌种mNGS耐药基因检出率和药敏最低抑菌浓度(MIC)耐药表型,分析mNGS和金标准耐药结果的一致性.结果 传统病原微生物培养共检出病原菌236株,其中革兰氏阴性菌阳性85例(173株),检出最多革兰氏阴性菌鲍曼不动杆菌36例(70株).mNGS检测共检出病原菌227株,革兰氏阴性菌阳性81例(168株),检出最多革兰氏阴性菌鲍曼不动杆菌34例(67株).Kappa 一致性分析结果显示mNGS检测诊断院内LRTIs患者BALF中革兰氏阴性菌的灵敏度、特异度、准确率及Kappa值分别为95.29％、93.94％、94.92％、0.876,诊断检出最多菌种鲍曼不动杆菌的灵敏度、特异度、准确率及Kappa值分别为94.44％、97.30％、95.89％、0.918;阳性组C反应蛋白(CRP)水平(319.38±93.84)mg/L、降钙素原(PCT)水平(11.86±3.56)ng/ml均高于阴性组上的CRP(104.15±32.71)mg/L、PCT(1.78±0.48)ng/ml(tCRP=12.847,tPCT=16.167,P＜0.05);鲍曼不动杆菌 mNGS 检出耐药基因表型均为β-内酰胺酶类,其中OXA-23表型检出占比最多为47.76％(32/67);亚胺培南耐药基因OXA-23、OXA-58耐药表型与传统病原微生物培养的Kappa值为0.914,青霉素和头孢菌素类耐药基因TEM、IMP及PER-1耐药表型与传统病原微生物培养的Kappa值为0.805.结论 mNGS在院内LRTIs患者BALF中对革兰氏阴性菌具有较高的诊断效能,与患者实验室血液学检测指标具有一定相关性,可较好预测鲍曼不动杆菌耐药表型,对指导临床精准用药具有重要应用价值.
关键词：宏基因组测序技术下呼吸道感染肺泡灌洗液革兰氏阴性菌诊断
分类号：R446.5(诊断学)
资助基金：上海静安区中心医院医学创新种子基金项目(JZ-2021zz09)
论文发表日期：2025-06-30
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 424-429 )
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