支持向量机方法预测离子通道蛋白
涂白
毕然
1.华中科技大学生命科学与技术学院,武汉,4300742.华中科技大学生命科学与技术学院,武汉,430074
摘要:讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白.通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较.通过留一法交叉验证,取得最好的预测效果,敏感度为95.9%,专一性为98.3%.
关键词:离子通道结构域支持向量机基因本体
分类号:Q816(生物工程学(生物技术))
资助基金:国家自然科学基金(90203011)
论文发表日期:2007-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:3( 8-10 )
