基于 OpenCL 的蛋白质转换算法
徐沛彦1
施慧彬2
1.南京航空航天大学计算机科学与技术学院 南京 2111062.南京航空航天大学计算机科学与技术学院 南京 211106; 软件新技术与产业化协同创新中心 南京 211106
摘要：为了提高蛋白质转换算法的加速比，提出了基于 OpenCL 的蛋白质转换算法。通过研究笛卡尔积算法中的并行性，论文首先在 CPU 中实现了串行蛋白质转换算法，再使用 OpenCL 技术在 GPU 中实现并行蛋白质转换算法。测试结果表明，使用 GPU 平均加速比为1．42x 。
关键词：蛋白质转换算法笛卡尔积OpenCL
分类号：TP301.6(计算技术、计算机技术)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 1420-1422,1435 )
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