基于蛋白质结构域特异性的关键蛋白质识别算法
杨増光
南京理工大学 南京 210094
摘要:关键蛋白质的识别对于理解细胞的生长调控过程、疾病研究和药物设计等方面具有重要的意义.随着高通量技术的发展,越来越多的蛋白质相互作用数据被获取,使得可以从网络水平上研究关键蛋白质.目前,许多基于蛋白质网络拓扑特征的算法被提出,但是这类方法忽略了蛋白质网络的生物信息和假阴性、假阳性数据的影响.因此,论文通过结合蛋白质结构域和蛋白质网络的拓扑特征提出了一种新的算法Do-ECC.实验结果表明,Do-ECC明显优于其他8种算法(DC,BC,CC,SC,EC,IC,LAC,NC).
关键词:蛋白质相互作用网络关键蛋白质边聚集系数蛋白质结构域TF-IDF
分类号:TP301.6(计算技术、计算机技术)
论文发表日期:2020-01-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 29-33,62 )
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