基于全基因组关联研究的tag SNP预测方法的研究与分析
刘高伟
中国石油大学(华东)计算机与通信工程学院 青岛 266580
摘要:SNP是指基因序列中碱基对的变异,通过对人体SNP位点进行基因分型,可以有效帮助人们找出与遗传疾病相关的基因.然而,对所有SNPs位点进行基因分型的成本过于昂贵.研究表明,部分最具有代表性的SNPs(标签SNP,tag SNP)就可以区分基因变异,选择高质量的tag SNP成为基因研究中的热点内容.论文提出一种基于连锁不平衡度的Genet-ic-majority dominance(GMD)tag SNP预测方法评估tag SNP质量,该方法通过对遗传算法每一次迭代选择的tag SNP集按照多数占优的原则进行预测,定量分析tag SNP集质量.结果表明,论文所提出的方法可以有效评估tag SNP集的质量.
关键词:SNPtag SNP遗传算法连锁不平衡
分类号:Q78(基因工程(遗传工程))
论文发表日期:2022-01-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 34-39 )
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计算机与数字工程

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ISSN:1672-9722
年,卷(期):2022,50(1)
所属栏目:算法与分析