生物序列变异进化中的结构关系挖掘与分析
高胜召
陈章昭
韩静
陈未如
张雪
沈阳化工大学计算机科学与技术学院 沈阳 110142;辽宁省化工过程工业智能化技术重点实验室 沈阳 110142
摘要：结构关系是指序列之间存在的并发、互斥、关联关系,生物序列中也存在这类结构关系,结构关系挖掘可以将这些结构关系提取出来,转化为有价值可利用的信息.论文将数据挖掘技术与生物信息技术相结合,对生物序列进行变异点提取和结构关系挖掘.作为测试案例,选取了新冠病毒序列作为挖掘对象,对五个国家的Delta(B.1.617.2)变异毒株的S蛋白质序列进行挖掘,发现这些序列相对于B.1参考序列均存在变异情况,且这些变异点之间包含并发、互斥、关联关系.对实验结果进行生物学分析,结合现有的病毒感染性和疫苗有效性等文献,证实挖掘得到的变异点的结构关系具有生物学意义.
关键词：生物序列结构关系并发关系互斥关系关联关系
分类号：TP311(计算技术、计算机技术)
资助基金：辽宁省自然基金项目(2022-MS-291)辽宁省教育厅科学研究项目(LJ2020024)辽宁省教育厅科学研究项目(2022)辽宁省教育厅基本科研项目(LJKMZ20220781)辽宁省教育厅基本科研项目(LJKMZ20220783)
论文发表日期：2025-09-20
在线出版日期：2025-12-23（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 2428-2432,2454 )
英文信息