DNA 序列非退化的二维图形表示及其应用
李春
刘欢
褚威威
费文超
韩苗苗
1.渤海大学 数理学院,辽宁 锦州,1210132.渤海大学 数理学院,辽宁 锦州,1210133.渤海大学 数理学院,辽宁 锦州,1210134.渤海大学 数理学院,辽宁 锦州,1210135.渤海大学 数理学院,辽宁 锦州,121013
摘要：提出了一种新的DNA序列的2－D图形表示方法，并证明了它的非退化性，随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标。在此基础上，结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度，将DNA序列转化为一个29维的数值向量。对23个物种的β球蛋白基因和18个物种的线粒体NADH脱氢酶序列进行的系统发生分析，证明了所提方法的有效性。
关键词：DNA2-D图形表示非退化ALE指标系统发生分析
分类号：Q71(生物大分子的结构和功能)
资助基金：国家自然科学基金项目(No11171042)辽宁省“百千万人才工程”项目(No2012921060)辽宁省高等学校创新团队(NoLT2014024)辽宁省食品安全重点实验室开放课题(NoLNSAKF2011034)
论文发表日期：2014-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 307-312,324 )
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