艰难梭菌数字化PCR-核糖体基因分型方法的建立与应用
束振华1
陈思达1
范回生2
古聪慧3
黄震1
1.深圳市龙岗中心医院,广东 深圳,5181152.深圳市龙岗区第五人民医院,广东 深圳,5181003.深圳市罗湖区人民医院,广东 深圳,518001
摘要：目的 建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体基因分型方法并用于临床菌株的基因分型.方法 利用荧光毛细管电泳技术代替琼脂糖凝胶电泳检测艰难梭菌PCR-核糖体分型产物,建立数字化PCR-核糖体分型方法;利用40株分属于10种核糖体型(RT)的艰难梭菌参考菌株构建常见基因型的数字化参考图谱,利用71株艰难梭菌临床菌株初步验证该方法的临床实用性.结果 荧光毛细管电泳技术准确地检测出40株艰难梭菌参考菌株的PCR-核糖体分型片段,并以数字化的形式呈现出来,10种核糖体型艰难梭菌的PCR-核糖体分型数字化图谱差异明显.同为RT027的21株菌株间、RT002的3株菌株间和RT015的2株菌株间的数字化分型结果相似性都非常高,而7株RT001菌株则可分为4种亚型,2株RT014分为2种亚型.49株深圳地区儿童中分离出的艰难梭菌共分为22种核糖体型,其中RT017共7株,BA03和BA16各5株,BA13共4株.22株悉尼地区莫西沙星耐药的艰难梭菌均为高毒力核糖体型027(RT027).结论 成功建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法,同时构建了艰难梭菌10种核糖体型的数字化PCR-核糖体分型参考数据库;深圳地区婴幼儿中分离出的艰难梭菌基因型以RT017为主,与国内成人中的分离株相似.悉尼地区莫西沙星耐药的艰难梭菌均为高毒力RT027.
关键词：艰难梭菌PCR-核糖体分型荧光毛细管电泳数字化参考数据库
分类号：R378.61(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
资助基金：深圳市龙岗区科技发展项目(20160606173802570)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 27-32,后插6-后插7 )
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