GEO数据库筛选肾透明细胞癌转移相关基因及其与免疫细胞浸润的关系
刘建生1
侯阳2
郑德宇3
1.锦州医科大学解剖学教研室实验教学平台2.锦州医科大学生命科学研究院3.锦州医科大学解剖学教研室,辽宁 锦州121000
摘要：目的 运用生物信息学方法探究转移肾透明细胞癌中的核心基因及信号通路.方法 从GEO数据库下载数据集GSE105288,筛选出与肾透明细胞癌差异基因,利用Metascape数据库,对DEGs进行GO、KEGG分析,同时使用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络,筛选出关键基因.通过GPIA、TIMER数据库、HPA数据库对关键枢纽基因进行验证和预后、 免疫浸润分析,筛选出核心基因.结果 获得差异基因379个,上调基因为242个,下调基因是137个.GO和KEGG分析显示,差异基因主要富集于细胞外基质、细胞粘附等.基因ISG15、GBP2与肾透明细胞癌患者的转移预后相关.结论 ISG15、GBP2基因可能对研究肾透明细胞癌的发生发展分子机制提供帮助,与肾透明细胞癌免疫细胞的浸润水平有关.
关键词：生物信息学肾透明细胞癌基因集富集分析相互作用网络关键基因免疫浸润
分类号：R737.11(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：辽宁省自然科学基金指导计划项目(20180550197)
论文发表日期：2022-10-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 12-18 )
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