非小细胞肺癌潜在生物标志物的研究

韩亮; 安玲; 何东宁

摘要：目的对非小细胞肺癌(nonsmall-cell lung cancer,NSCLC)及癌旁组织差异表达微小 RNA(minimal RNA,miRNA)数据集进行分析,寻找有关键调控作用的miRNA及靶向信使RNA(messenger RNA,mRNA),阐述目标miRNA在非小细胞肺癌中发挥的生物学功能,为非小细胞肺癌提供早期诊断标志物.方法利用GEO数据库获得NSCLC癌组织与癌旁组织相关基因表达谱数据(GES102286)并对该数据集进行分析,获得差异性miRNA表达谱.对明显差异表达miR-NA进行靶向mRNA预测,通过基因本体(gene ontology,GO)、KEGG信号通路富集及String蛋白互作分析靶向mRNA发挥的生物学功能.收集2016 年1 月至2021 年8 月31 日锦州医科大学附属第三医院收治的 72 例NSCLC患者癌组织标本,选取正常肺组织标本30 例作为对照组.使用免疫组织化学方法检测NSCLC组织中PTEN蛋白的表达,分析在NSCLC患者中PTEN表达水平与临床病理特征之间的关系.结果数据集GSE102286 得到上调和下调基因各 6 个(| FC|>1.5,P<0.05),miR-486-5p作为明显差异表达miRNA在癌旁组织中表达水平显著降低,下降倍数为 2.505.经 miRanda、Tar-getScan及encori数据库对miR-486-5p进行靶向mRNA预测,发现3 个数据库共存在72 个交集靶向mRNA.基因本体分析发现,靶向基因主要在调控细胞凋亡、直接转录因子结合、调控转录过程等方面发挥调控作用;KEGG通路富集分析发现靶向基因主要参与非小细胞肺癌、mTOR及FOXO1 等信号通路;String蛋白互作分析发现,PTEN、PIK3R1 作为蛋白调控网络中的枢纽基因在mir-486-5p的生物学功能中占主要地位.NSCLC组织中PTEN阳性表达率较正常肺组织明显降低,差异具有统计学意义(P<0.05).PTEN阳性表达通常伴随着较早的临床分期与未发生淋巴结转移,差异具有统计学意义(P<0.05).结论 miR-486-5p在NSCLC中表达显著降低,其可能通过某种途径调控PTEN从而影响PI3K-AKT-MTOR通路在NSCLC发生发展过程中发挥重要作用,成为NSCLC的有效临床标志物.