基于孟德尔随机化和生物信息学方法鉴定胶质瘤发病关键基因及实验验证
赵茜
冯晓诗
苗野
锦州医科大学附属第一医院,辽宁 锦州 121000
摘要：目的 鉴定和验证胶质瘤发生发展及预后的相关基因.方法 利用孟德尔随机化方法筛选与胶质瘤发生风险相关的蛋白.基于TCGA数据库获取胶质瘤组织与癌旁组织的差异表达基因,整合风险蛋白和差异表达基因,并使用LASSO回归分析进一步筛选关键基因;使用ROC曲线、生存分析和免疫浸润分析方法评估关键基因与胶质瘤的关联效应;体外培养人胶质瘤U251 细胞,构建干扰半乳糖凝集素3 结合蛋白(lectin galactoside-binding soluble 3 binding protein,LGALS3BP)基因表达的siRNA序列,验证其对肿瘤细胞增殖、侵袭和迁移的影响.结果 共发现 34 种血液蛋白与胶质瘤风险增加相关,30 种蛋白与风险降低相关;与差异表达基因整合并进行LASSO回归分析后,7 个关键基因包括IBSP、SEMA6B、PPIC、ISLR2、SCN2B、HAVCR2 和LGALS3BP被确定.体外实验证实,干预LGALS3BP在胶质瘤细胞系U251 中的表达可明显抑制肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭能力.结论 本研究基于孟德尔随机化、生物信息学方法鉴定胶质瘤发生发展及预后的相关新基因,并初步证实关键基因LGALS3BP在胶质瘤发生发展中的关键作用.
关键词：胶质瘤孟德尔随机化差异表达分析预后LGALS3BP
分类号：R739.4(神经系肿瘤)
资助基金：辽宁省教育厅高等学校基本科研青年项目(JYTQN2023430)锦州市指导性科技计划项目(JZ2023B058)
论文发表日期：2024-08-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 1-10 )
英文信息