N连接糖基化过程的动态图建模
杨岱巍
王晶
周靖林
吴海燕
靳其兵
1.北京化工大学信息科学与技术学院,北京,1000292.北京化工大学信息科学与技术学院,北京,1000293.北京化工大学信息科学与技术学院,北京,1000294.北京化工大学信息科学与技术学院,北京,1000295.北京化工大学信息科学与技术学院,北京,100029
摘要：单克隆抗体药物是当前国际市场上最具价值的药品种类之一,而N连接糖基化反应是单克隆抗体制备过程中非常重要的一个环节.本文采用有向图来描述糖蛋白结构,图模型描述反应网络,因此可以方便地采用分支限界法来生成整个反应网络.而且在这种图模型表示的反应网络中,糖基化反应的分析计算会变得更为容易.综合考虑实际细胞动态变化中高尔基体内转运反应的影响,提出了N连接糖基化反应的动态平衡方程,相比较现有的稳态模型可以提供更多的反应过程信息,并且为反应质量的实时控制做出了理论依据.另外,本文以理论计算与实测值偏差为目标,采用遗传算法对反应过程的大量生化参数进行优化,从而提高计算模型的精度.为了提升仿真模型的计算能力和对实验设计的指导作用,本文基于C++开发了一款专用的糖基化仿真计算平台,提供网络结构的可视化、反应过程的动态曲线、反应参数优化等功能.通过对比本文模型的数据分析与实际机理分析一致验证了模型的有效性.
关键词：N连接糖基化过程图模型反应网络动态物料平衡模型仿真平台
分类号：TP29(自动化技术及设备)
资助基金：国家自然科学基金项目(61573050)国家自然科学基金项目( 61403017)国家自然科学基金项目( 61473025)中国科学院自动化研究所复杂系统与智能科学重点实验室开放课题(20160107)Supported by National Natural Science Foundation of China(61573050)Supported by National Natural Science Foundation of China( 61403017)Supported by National Natural Science Foundation of China( 61473025)Key Laboratory of Complex Systems and Intelli-gent, Science, Institute of Automation, Chinese Academy of Sciences(20160107)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 627-636 )
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