针对蛋白质复合体检测的自学习图聚类
朱佳1
武兴成1
林雪琴1
肖丹阳1
肖菁1
黄晋1
贺超波2
1.华南师范大学计算机学院,广东广州,5106312.仲恺农业工程学院信息科学与技术学院,广东广州,510225
摘要：蛋白质复合体是由两条或多条相关联的多肽链组成,在生物过程中起着重要作用.假如用图表示蛋白质–蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络数据,那么从中找出紧密耦合的蛋白质复合体是非常困难的,特别是在近年来PPI网络的容量大大增加的情况下.在本文中,通过对称非负矩阵分解,针对蛋白质复合体检测问题提出了一种图聚类方法,该方法可以有效地从复杂网络中检测密集的连通子图.并且将此方法和当前最先进的一些方法在3个PPI数据集中用同一个基准进行比较.实验结果表明,本文的方法在3个拥有不同大小和密度的数据集中均显著优于其它方法.
关键词：图聚类蛋白质复合体非负矩阵分解
分类号：TP273(自动化技术及设备)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 776-782 )
英文信息