端粒G-四链体结合酞菁分子的分子模拟研究
楼晓勤
黄依宁
许奕
王梦露
李建峰
王志国
杭州师范大学 医学部,浙江 杭州 311121
摘要:为揭示负电性稳定剂与人端粒G-四链体的作用机制,采用分子对接和分子动力学方法对新型负电性四磺酸酞菁分子(anionic phthalocyanine 3,4′,4″,4?-tetrasulfonic acid)和人端粒平行构象G-四链体进行了系统研究.构象分析发现,酞菁分子能够单独或同时稳定结合于G-四链体的顶层和底层G-四分体平面并有效提高G-四链体的稳定性;结合自由能分析表明,酞菁分子堆叠于顶层G-四分体的结合模式在能量上更为有利,同时第二个酞菁分子的引入能够进一步提升结合强度.这些发现对新型端粒G-四链体稳定剂的开发具有重要的指导意义.
关键词:G-四链体端粒分子对接分子动力学结合自由能
分类号:Q641.3(生物电磁学)
资助基金:国家自然科学基金(81971311)浙江省自然科学基金(LY18H250002)
论文发表日期:2021-06-28
在线出版日期:2026-08-28(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 91-100 )
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聊城大学学报(自然科学版)

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ISSN:1672-6634
年,卷(期):2021,34(3)
所属栏目:药学研究