一株3,5,6-三氯-2-吡啶酚降解菌的全基因组测序及功能挖掘
岳彩旭
贾楠
吕雪茹
刘世豪
王圣惠
聊城大学 生命科学学院,山东 聊城 252059
摘要:Micrococcus luteus ML是从长期使用毒死蜱的农田土壤中分离出的一株能够降解毒死蜱及其高毒残留物 3,5,6-三氯-2-吡啶酚(TCP)的菌株.探究菌株 ML 降解机制,挖掘新型 TCP 代谢基因和特异代谢功能.采用Illumina Novaseq PE150 和 Oxford Nanopore ONT相结合的测序技术对菌株ML进行全基因组测序.该菌株有 52 个编码基因参与了异源化合物的代谢,共有 15 种酶参与了 TCP 结构类似物,如氯苯甲酸、氨基苯甲酸盐、甲苯、萘、氯代烷烃和氯代烯烃的降解.初步推测羧甲基丁内酯酶和酰胺酶分别参与了菌株ML对TCP的脱氯和脱氯产物吡啶环中氮转化为氨的反应,这为探究Micrococcus luteus ML 功能基因组学研究及对TCP的降解特性提供了数据支持.
关键词:356-三氯-2-吡啶酚降解藤黄微球菌全基因组测序功能挖掘
分类号:X172(环境生物学)
资助基金:国家自然科学基金(41401288)山东省自然科学基金面上项目(ZR2020MD103)大学生创新创业训练项目(CXCY2022055)大学生创新创业训练项目(CXCY2022223)聊城大学畜牧学学科开放课题(319312101-19)聊城大学畜牧学学科开放课题(319312101-20)
论文发表日期:2023-08-28
在线出版日期:2026-08-28(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 101-110 )
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