基于与免疫检查点基因相关的基底膜基因构建预测肝癌患者预后模型及相关功能和潜在药物研究
谭天华1
许静涌2
宋京海2
1.100730 北京,中国医学科学院北京协和医学院国家老年医学中心北京医院肝胆胰外科;100024 北京,首都医科大学附属北京朝阳医院普通外科2.100730 北京,中国医学科学院北京协和医学院国家老年医学中心北京医院肝胆胰外科
摘要：目的 探讨基于与免疫检查点基因相关的基底膜基因构建预测肝癌患者预后模型的可行性,并进行相关性分析及药物敏感性差异分析.方法 从癌症基因组图谱数据库中获取大规模的肝癌患者数据,包括转录组数据、临床特征数据和突变数据.通过整合这些数据,构建一个预后模型,并选择与免疫检查点基因相关的基底膜基因作为独立预后蛋白.通过独立预后分析验证模型的独立性.另外行免疫相关性分析,评估高风险组和低风险组患者之间的差异基因和免疫相关功能.最后进行药物敏感性分析,评估不同风险组患者对常用药物的敏感性差异.结果 根据多变量Cox回归分析得出预后模型公式:风险评分=(1.25968690844101×ADAMTS5表达)+(0.332985729856301×CTSA表达)+(-0.31683170952125×FBLN5表达)+(0.346521502281786×P3H1表达).免疫相关性分析揭示了高风险组和低风险组患者之间的差异基因和免疫相关功能,差异基因包括Cytolytic_activity、Type_Ⅰ_IFN_Reponse、Type_Ⅱ_IFN_Reponse和MHC_class_Ⅰ.单因素预后分析,风险评分的HR和95%CI分别为1.201和1.132,1.274(P＜0.01);多因素预后分析,风险评分的HR和95%CI分别为1.174和1.102,1.251(P＜0.01).受试者工作特征曲线显示,1、3和5年曲线下面积均大于0.5.一致性指数(C-index)曲线显示所构建的模型C-index值最大.药物敏感性分析发现高风险组和低风险组患者在Cyclopamine、Epothilone B、Foretinib、Imatinib、Midostaurin、Oba-toclax Mesylate、Paclitaxel、Pyrimethamine、Sorafenib、Thapsigargin、Tipifarnib和Vinorelbine等的敏感性上存在显著差异.结论 基于与免疫检查点基因相关的基底膜基因的预后模型对肝癌预后有潜在预测价值,其免疫相关性分析和药物敏感性分析可提供肝癌免疫状态和个体化治疗信息,可为肝癌的预后评估和治疗决策提供新的工具和指导,有助于改善患者的生存率和生活质量.
关键词：肝肿瘤预后模型免疫检查点基底膜基因免疫功能相关性药物筛选
分类号：R735.7(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(32001373)
论文发表日期：2024-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 25-33 )
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