长链非编码RNA在结肠癌中的表达研究
曹伟军
吴海露
张予蜀
陈震球
袁捷
张振玉
1.210006,南京 南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科2.210006,南京 南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科3.210006,南京 南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科4.210006,南京 南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科5.210006,南京 南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科6.210006,南京 南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科
摘要：目的 探讨长链非编码RNA (lncRNA)在结肠癌中的表达情况.方法 从公共数据平台Gene ExpressionOmnibus (GEO)下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织.对外显子芯片探针进行重排,筛选出在基因水平特异性匹配lncRNA的探针.用Affymetrix Power Tools分析获得lncRNA表达谱,用LIMMA分析在结肠癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA.结果 共有136 053个探针特异性匹配9294个lncRNA,约包含了Ensembl数据库中76％的ln-cRNA.分析GSE31737发现,与癌旁组织相比,结肠癌组织中共有87个lncRNA差异表达,其中50个高表达,37个低表达.结肠癌与癌旁组织表达值倍数变化＞1.5倍的基因共37个.结论 lncRNA表达在结肠癌组织中发生明显变化,有可能成为结肠癌的分子诊断和基因治疗的新靶点.
关键词：结肠癌长链非编码RNA基因芯片
分类号：R735.3(消化系肿瘤)
论文发表日期：2013-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 882-886 )
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