利用GEO及TCGA数据集分析SMARCA1在胃癌中的表达及其临床意义
郭金锋
王硕
郭天舒
李智
1.110001,沈阳 中国医科大学附属第一医院肿瘤内科2.110001,沈阳 中国医科大学附属第一医院肿瘤内科3.110001,沈阳 中国医科大学附属第一医院肿瘤内科4.110001,沈阳 中国医科大学附属第一医院肿瘤内科
摘要：目的 探讨基因表达汇编(GEO)及癌症和肿瘤基因表达图谱(TCGA)数据集中胃癌组织的SMARCA1表达情况及其与胃癌临床病理特征和预后的关系.方法 利用GEO和TCGA数据集汇总胃癌相关数据,下载胃癌组织SMARCA1表达数据及临床病理参数.分析SMARCA1表达与胃癌临床病理学特征和总生存期(0S)的关系;采用基因集富集分析(GSEA)预测SMARCA1相关的基因通路.结果 在GSE62254数据集中,SMARCA1表达与T分期有关(P=0.022),而与TNM分期、性别、年龄和N分期均无关(P＞0.05).在TCGA数据集中,SMARCA1表达与T分期、性别、年龄、N分期、TNM分期和组织学分级均无关(P＞0.05).GSE62254数据集中,SMARCA1高、中及低表达组胃癌患者的中位OS分别为36.4个月、89.4个月和未达(P=0.001);TCGA数据集中,SMARCA1高、中及低表达组胃癌患者的中位OS分别为23.7个月、29.4个月和56.2个月(P=0.033).GSEA结果显示,SMARCA1高表达样本富集了K-Ras、Akt、BMI-1和mTOR通路等基因集.结论 胃癌组织中SMARCA1的表达与T分期有关,高表达患者的预后不良,可作为潜在评估胃癌预后的分子标志物.
关键词：胃癌基因表达汇编(GEO)癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)SMARCA1预后
分类号：R735.2(消化系肿瘤)
资助基金：重大慢性非传染性疾病防控研究资助项目(2017YFC1308900)重大新药创制"科技重大专项(2017ZX09304025)辽宁省中央引导地方科技发展专项资金资助项目(2016007010)沈阳市重点科技研发计划(人口与健康科技研发主题专项)资助项目(17-230-9-01)
论文发表日期：2018-06-02
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 528-532 )
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