基于生物信息学探讨IFIH1和SAMD9L在胶质母细胞瘤抗肿瘤免疫中的作用
侯波1
孙冬雪1
宋飞龙1
张赛2
涂悦2
王振国2
滕川1
1.255200 山东淄博 淄博市第一医院神经外科2.300162 武警特色医学中心神经外科
摘要：目的 通过生物信息学数据库筛选及分析,并结合临床验证,探讨胶质母细胞瘤(GBM)的基因表达变化及其可能的作用机制.方法 在GEO数据库检索GBM基因数据集,通过GEO2R在线工具处理,将各数据集的基因进行韦恩图分析,筛选出差异基因(DEGs).利用String网站构建DEGs蛋白互作(PPI)网络图,并进行功能富集分析;采用Cytoscape软件MCODE插件识别PPI网络中的关键模块、CytoHubba插件筛选PPI网络中的Hub基因.在GEPIA网站观察Hub基因的表达水平及其对生存率的影响.以2017年6月至2019年12月经手术切除且病理证实的GBM患者40例为研究组,15例正常人为对照组.采用ELISA法检测两组血清干扰素 β(IFN-β)、趋化因子C-X-C配体10(CXCL10)、干扰素诱导蛋白44样(IFI44L)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量;采用实时荧光定量PCR测定GBM组织及瘤周正常组织中的基因表达水平,并对其进行相关性分析.结果 纳入GSE2223、GSE4290及GSE15824三个数据集,筛选出83个DEGs.共识别出8个Hub基因,其中IFIH1和SAMD9L对患者生存率有潜在影响,且两者呈正相关(r=0.86,P<0.001).GBM患者血清IFN-β、CXCL10、IFI44L和TNF-α含量均高于对照组(P<0.001).GBM组织中SAMD9L表达量明显高于瘤周正常组织(6.00±2.98 vs.1.06±0.49,P<0.001),IFIH1表达量亦明显高于瘤周正常组织(4.05±1.90 vs.1.01±0.57,P<0.001),且GBM组织中IFIH1和SAMD9L表达量呈正相关(r=0.663,P<0.001);IFIH1、SAMD9L基因表达与血清IFN-β、CXCL10、IFI44L含量均呈正相关(P均<0.05).IFIH1、SAMD9L高表达组的中位OS分别为16.5个月、17个月,均低于低表达组(P<0.05).结论 GBM患者IF-IH1和SAMD9L基因表达上调且存在相关性,并降低了生存率;两者与机体抗肿瘤免疫系统激活密切相关,可能是免疫治疗GBM的新靶点.
关键词：胶质母细胞瘤免疫IFIH1SAMD9L生物信息学
分类号：R739.41(神经系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(81771350)天津市科技计划(16ZXHLSY00120)
论文发表日期：2021-05-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 430-436 )
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