基于GEO数据库的小细胞肺癌lncRNA-miRNA-mRNA网络的构建与潜在的诊治靶点分析
王曦帆1
朱传东2
陈芳芳1
1.210002 南京 解放军东部战区总医院检验医学研究所基础医学实验室2.210003 南京中医药大学附属南京市第二医院肿瘤科
摘要：目的 筛选参与小细胞肺癌(SCLC)发生发展的ncRNAs,预测其诊治的潜在靶点.方法 对人类肿瘤相关基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中获得的表达谱芯片数据进行差异基因分析,构建了ceRNA网络,并进行功能富集分析、PPI网络构建.收集7例手术治疗的小细胞肺癌患者,采用实时定量PCR(qPCR)对部分差异基因(lncRNA、mRNA和miRNA)进行临床样本验证.结果 共有99个lncRNA、46个miRNA和73个mRNA分子参与调控网络的构建.GO和KEGG分析表明失调的mRNA主要参与小细胞肺癌的细胞癌变、增殖以及转移.PPI网络分析提示46个基因被认为是中心基因.qPCR结果显示,与癌旁组织比较,小细胞肺癌组织中lnc-ENST00000430027.3呈相对高表达(P<0.001),hsa-miR-143-5p呈相对低表达(P<0.01),FANCA呈相对高表达(P<0.01).结论 构建"lncRNA-miRNA-mRNA"的ceRNA调控网络,可为小细胞肺癌诊治提供新的依据和靶点,为小细胞肺癌诊断和治疗的分子生物学研究提供新的依据.
关键词：小细胞肺癌生物信息学竞争性内源RNA长链非编码RNA
分类号：R734.2(呼吸系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82002233)
论文发表日期：2023-02-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 97-104 )
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