生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌中的作用及临床验证
黄亮
高东
周丹丹
陈方红
615000 四川西昌 凉山彝族自治州第一人民医院肿瘤科
摘要：目的 生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌(BC)中的作用并进行临床验证.方法 BC的队列数据集来自高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA),并通过生物信息学工具进行分析.在临床验证中,前瞻性纳入2018 年 1 月至 2022 年 2 月接受手术的BC患者(BC组),获取 BC组织和对应的癌旁正常组织.另纳入同期 150 例体检健康女性作为对照组,获取其血清样本,采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测组织及血清miR-16-5p表达.所有BC患者至少随访3 年.结果 共鉴定出 195 个差异表达基因(DEG),根据logFC≥1.5 或logFC≤-1.5 阈值,miR-16-5p表达显著下调,其受试者工作特征(ROC)曲线和Kaplan-Meier曲线分析显示,miR-16-5p区分BC组织及正常乳腺组织的曲线下面积(AUC)为 0.73(95%CI:0.68～0.79),且miR-16-5p低表达的患者预后较差(P=0.013),因此miR-16-5p可作为候选miRNA.在临床验证集中,BC组织miR-16-5p相对表达量明显低于癌旁正常组织[0.46(0.29,0.66)vs.0.82(0.56,1.08),P＜0.001].且BC患者血清miR-16-5p相对表达量也显著低于对照组[0.34(0.15,0.50)vs.0.99(0.70,1.20),P＜0.001].ROC曲线显示,当血清miR-16-5p相对表达量≤0.520 时可良好地诊断BC患者,AUC值为0.897(95%CI:0.863～0.932).BC患者血清样本和BC组织样本中miR-16-5p相对表达量呈正相关(rs= 0.373,P＜0.001).血清 miR-16-5p 表达与 T 分期、N 分期、TNM 分期有关(P＜0.05).血清miR-16-5p低表达组是影响BC患者患者 3 年内发生局部复发/远处转移及死亡的独立预测生物标志物(P＜0.05).结论 血清miR-16-5p表达对BC有诊断效能,低血清miR-16-5p表达预示着BC患者更差的疾病进展情况和 3 年内预后不良.
关键词：乳腺癌GEO癌症基因组图谱miR-16-5p临床验证
分类号：R737.9(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期：2023-06-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 488-494 )
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