基于生物信息技术探讨雷公藤调控透明细胞肾细胞癌的分子作用机制
王兴东
吴波
李祥
王玥坤
骆雨璇
210002 南京 解放军东部战区总医院药剂科
摘要：目的 通过生物信息学技术筛选雷公藤与透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的共同靶基因,为ccRCC治疗提供新的思路和靶点.方法 从GEO数据库下载ccRCC芯片数据集GSE168845,用在线分析工具GEO2R筛选癌组织与配对的非癌性肾组织间的差异表达基因.从中药分子机制的生物信息数据平台(BATMAN-TCM)获取雷公藤的作用靶点,并与差异表达基因相交,得到共同靶基因.利用STRING和DAVID在线数据库进行共同靶基因功能分析、通路富集分析和蛋白相互作用网络分析,Cytoscape3.7.1 版软件对蛋白互作网络行可视化和关键靶点分析.结果 ccRCC组织和正常肾组织间有 535 个差异表达基因,其中上调基因123 个,下调基因412 个.BATMAN-TCM数据库预测到雷公藤调控靶点478 个,两者共同靶点58 个.蛋白互作网络关键基因涉及IL-6、INS、CFTR、IL-4、IL-1B、CASR、ADORA3 和PTGER3;基因本体分析显示,共同靶基因主要富集在对刺激反应、对药物反应、参与多细胞生物过程的调节等生物过程.京都基因与基因组百科全书通路主要富集在PI3K/Akt信号通路、环磷酸腺苷信号通路、NOD样受体信号通路、IL-17 信号通路和钙信号通路等.结论 IL-6、INS、CFTR及PT-GER3 可能参与了雷公藤治疗ccRCC的生物过程,本研究为进一步深入理解雷公藤治疗ccRCC的生物学机制和探索ccRCC的治疗方案提供了新思路.
关键词：透明细胞肾细胞癌雷公藤生物信息技术作用机制
分类号：R737.11(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期：2023-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 621-626 )
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