生物信息学分析姜黄素与非小细胞肺癌预后的关系
崔海涛1
王蕊红2
赵鹏3
赵晓雯2
王晔3
1.266071 山东青岛 青岛大学医学部;266300 青岛市胶州中心医院检验科2.266071 山东青岛 青岛大学医学部;266011 青岛大学附属青岛市中心医院中心实验室3.266071 山东青岛 青岛大学医学部;266011 青岛大学附属青岛市中心医院检验科
摘要：目的 探讨姜黄素通过调节铁死亡相关基因表达影响非小细胞肺癌(NSCLC)患者预后的作用机制.方法 采用 50 μmol/L姜黄素和等体积DMSO处理A549 细胞 24 h后进行转录组测序,对差异表达基因进行富集分析(GSEA).将富集到的基因集进行蛋白质互作(PPI)分析并同时进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),获得与铁死亡相关基因集和表达水平.采用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库( 1017 个患者样本和 108 个正常样本,与姜黄素处理的细胞转录组数据进行相互验证.结果 WGCNA分析结果显示,brown4 模块与PI3K-AKT-mTOR通路具有显著关系,而brown4 模块基因和差异表达基因、铁死亡相关基因集分析显示,共 23 个交集基因.预后分析结果显示ACSL3、BACH1、FTH1、SLC11A2 基因与NSCLC患者预后有关,而其在姜黄素处理前后中的表达存在显著差异.免疫浸润分析显示,巨噬细胞浸润水平与ACSL3、BACH1、SLC11A2 呈正相关,与FTH1 呈负相关.结论 通过整合转录组学及TCGA公共数据库数据,发现姜黄素可通过干预铁死亡相关基因表达改善患者预后.
关键词：非小细胞肺癌姜黄素铁死亡癌症和肿瘤基因图谱免疫
分类号：R734.2(呼吸系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82072927)
论文发表日期：2023-10-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 881-886 )
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