非小细胞肺癌组织中环状RNA调控网络的相关分析
姜林宏1
张鹤达2
王丹丹2
唐金海2
李蕾2
1.210029 南京 南京医科大学第一附属医院放疗科2.210029 南京医科大学第一附属医院普外科
摘要：目的 探索非小细胞肺癌(NSCLC)组织中差异表达的环状RNA(circRNAs)以寻求有意义的肿瘤标志物.方法 利用GEO数据库获取NSCLC组织中circRNAs和微小RNAs(miRNAs)的表达数据,利用R软件进行差异分析;借助miRanda和 RNAhybrid 软件预测circRNAs可结合的miRNAs,与差异表达的miRNAs取交集并构建circRNAs-miRNAs相互作用网络图;通过TCGA数据库分析其亲本基因在肺鳞状细胞癌组织中的表达,通过Kaplan-Meier Plotter软件进行生存分析.结果 通过对 2 个GEO数据库(GSE101586 和GSE112214)进行合并分析,发现共有 148 个差异表达的circRNAs(上调 14 个、下调 134 个);GEO分析肺癌组织中差异表达的miRNAs共有 975 个,其中有 70 个miRNAs与倍数差异排名前 8 的circRNAs预测的miRNAs重合.通过TCGA组织表达分析发现,PDK1、CYP24A1 在肺鳞状细胞癌组织中表达增加,而LIFR、NTNG1 表达降低,与circRNAs表达趋势一致;生存分析发现GCLC、PDK1 和NTNG1 的高表达与肺鳞状细胞癌患者较差的总生存率密切相关,而LIFR和KLHL20 则与之相反.结论 在NSCLC组织中的差异表达circRNAs将成为有前景的肿瘤标志物.
关键词：非小细胞肺癌环状RNA微小RNA亲本基因
分类号：R734.2(呼吸系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82102780)江苏省高层次创新创业人才引进计划双创博士资助项目(303073540ER21)江苏省人民医院临床能力提升工程项目(JSPH-MC-2022-26)
论文发表日期：2023-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 992-997 )
英文信息