结直肠癌预后相关铁死亡基因筛选及预后预测模型构建
李雯雯1
骆子荣2
余卫锋3
贝佳敏4
何桂花5
钟彩玲5
黄穗平5
张北平5
1.510405 广州 广州中医药大学第二临床医学院2.523808 东莞松山湖高新技术产业开发区社区卫生服务中心3.518100 深圳市中西医结合医院脾胃病科4.510405 广州中医药大学第三临床医学院5.510120 广州中医药大学第二附属医院脾胃病科
摘要：目的 基于生物信息学方法筛选并分析与结直肠癌(CRC)预后相关的铁死亡相关基因(FRGs),构建临床预后模型.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取结直肠癌预后样本基因,单因素Cox回归分析后得到预后相关基因,从FerrDb数据库中获取FRGs,取交集后得到预后相关FRGs.通过LASSO-Cox回归分析构建预后模型.以预后模型的风险评分的中位数为临界值,将CRC患者分为高风险组和低风险组,并绘制生存曲线,使用受试者工作特征(ROC)曲线评价FRGs模型的诊断效能.采用单因素和多因素Cox回归分析确定影响患者总生存期(OS)的独立预后因素.通过GeneMANIA数据库对预后模型中的基因进行蛋白互作网络分析,同时通过Metascap数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 通过LASSO-Cox回归分析共筛选出 11 个有预后价值的FRGs,并以此构建预后模型.Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险组患者的OS较低风险组更短,差异有统计学意义(P<0.05).ROC曲线提示预后模型诊断效果良好.单因素和多因素Cox回归分析显示,T分期、N分期、病理分期、年龄、残余瘤及风险评分是影响预后的独立因素(P<0.05).蛋白互作网络分析结果提示其蛋白互作网络功能主要与大自噬、铁离子转运等相关.功能富集分析显示,11 个预后相关FRGs在膜电位调控、自噬和逆行内源性大麻素信号等通路均有显著富集.结论 经生物信息学方法筛选出的 11 个预后相关FRGs组成的预后模型对CRC患者的预后有较好的预测价值,可能为CRC患者提供预后评估方面的依据.
关键词：结直肠癌铁死亡预后模型生物信息学
分类号：R735.3(消化系肿瘤)
资助基金：广东省教育厅高校科研项目(2021ZDZX2059)广州市科技计划项目(202201020377)广东省方证重点实验室(2022B1212010012-2)
论文发表日期：2024-02-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 160-167 )
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