基于生物信息学探讨复发性静脉血栓栓塞症易感基因在恶性肿瘤中的临床意义
初晓玲
相芳
蓝晓红
吴波
210002 南京 解放军东部战区总医院药剂科
摘要：目的 探讨复发性静脉血栓栓塞症(VTE)的发病机理及其与恶性肿瘤的相关性,运用生物信息学预测易感基因并分析其在肿瘤组织中的表达和总生存期(OS).方法 基因预测基于GEO2R在线分析工具对GSE19151芯片分析,筛选差异表达基因(DEGs)进行基因本体(GO)生物学过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,构建PPI网络获取关键基因与疾病相关基因取交集,得到易感基因.利用GEPIA2数据库分析易感基因在肿瘤中的表达及预后情况.结果 共筛选出211个DEGs,其中上调49个、下调162个.上调基因GO生物学过程主要涉及生长素响应因子(ARF)蛋白信号转导的调节、B细胞受体信号通路、Rho蛋白信号转导和细胞外渗的正向调节等;KEGG信号通路涉及志贺氏菌病、人类T细胞白血病病毒Ⅰ型感染、磷脂酶D信号通路、Rap1信号通路和磷脂酰肌醇信号通路等.PPI网络分析出19个关键基因,与疾病相关基因相交,得到5个易感基因,分别为TP53、ICAM1、PIK3CD、PLEC和TLN1.与其他肿瘤比较,易感基因在脑胶质瘤中分布较为集中,TP53、ICAM1、PIK3CD和TLN1高表达者的OS显著低于低表达(P＜0.05),TP53、ICAM1和TLN1在脑胶质瘤肿瘤组织中的表达显著高于正常组织(P＜0.05).结论 通过生物信息学的分析方法挖掘出TP53、ICAM1、PIK3CD、PLEC和TLN1可能是复发性VTE的潜在标志物,其基因表达与肿瘤不良预后显著相关,为研究恶性肿瘤诱发VTE提供线索及方向.
关键词：复发性静脉血栓栓塞症恶性肿瘤生物信息学易感基因总生存
分类号：R730(一般性问题)
资助基金：国家自然科学基金(82060739)
论文发表日期：2024-05-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 483-488 )
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