基于TCGA数据库分析结直肠癌中LOC676462表达及临床意义
甄洪超1
谢俏2
曹邦伟1
1.100050 北京 首都医科大学附属北京友谊医院肿瘤科2.100020 北京市垂杨柳医院消化内科
摘要:目的 探讨结直肠癌中lncRNA LOC676462 表达及其与临床病理特征、预后的相关性.方法 在癌症基因图谱(TCGA)数据库网站中下载结直肠癌RNA转录组数据及临床数据,进行LOC676462 表达差异分析及生存分析.采用TIMER 2.0 对LOC676462 进行泛癌表达水平分析.收集首都医科大学附属北京友谊医院经手术治疗的 100 例结直肠癌肿瘤组织及癌旁组织标本,采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测LOC676462 表达量,分析LOC676462 表达与结直肠癌者临床病理特征的关系.受试者特征工作曲线(ROC)分析LOC676462 表达诊断结直肠癌的效能.Kaplan-meier法绘制总生存(OS)曲线.采用多因素Cox风险比例回归模型分析影响结直肠癌OS的因素.结果 生物信息学分析结果显示,LOC676462 在结直肠癌组织中高表达.100 例结直肠癌组织中LOC676462 表达量为 3.421±2.250,高于癌旁组织的 1±0.694,差异有统计学意义(P<0.05).LOC676462 表达与TNM分期、浸润深度及淋巴结转移有关(P<0.05).ROC曲线分析表明,LOC676462 表达诊断结直肠癌的曲线下面积为 0.918(95%CI:0.882~0.955).Kaplan-Meier结果显示,LOC676462 高表达患者的 5 年总生存率为38%,低表达患者5 年总生存率为65.9%,差异有统计学意义(P<0.05).多因素Cox风险比例回归模型分析结果显示,TNM分期、浸润深度、肿瘤分化程度以及 LOC676462 表达是影响结直肠癌 OS 的独立因素(P<0.05).结论 长链非编码 RNA LOC676462 可作为促癌基因参与在结直肠癌的发生与发展,并且其可能是结直肠癌潜在的生物标志物,可作为预测结直肠癌患者生存预后的指标.
关键词:结直肠癌长链非编码RNATCGA数据库预后临床病理特征
分类号:R735.3(消化系肿瘤)
论文发表日期:2024-06-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 539-544 )
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临床肿瘤学杂志

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ISSN:1009-0460
年,卷(期):2024,29(6)
所属栏目:论著