泛素羧基末端水解酶L5调控肝细胞癌下游靶标的生物信息学机制研究
刘子瑶
沈洁
谢正尧
210008 南京 南京大学医学院附属鼓楼医院精准医学中心
摘要:目的 基于生物信息学方法探讨泛素羧基末端水解酶L5(UCHL5)在肝细胞癌中的表达特征、靶标结合模式及其对下游基因的调控机制,以评估其作为潜在治疗靶点和免疫治疗疗效预测分子的临床价值.方法 基于UALCAN数据库分析UCHL5 在不同亚组肝癌患者中的表达情况;使用CIBERSORT和maftools进行免疫浸润和肿瘤突变负荷分析;survival和survminer进行生存分析;通过eCLIP数据分析UCHL5 的靶标结合情况;结合敲降RNA-seq的转录组学数据分析UCHL5 对靶标转录水平调控的机制.结果 肝癌组织中的UCHL5 表达水平显著升高(P<0.0001),其表达在肝癌 2 级和 3 级间的差异有统计学意义(P<0.05),有无TP53 变异的肝癌组织的UCHL5 表达量具有显著差异(P<0.0001).UCHL5 低表达组的浆细胞和调节性T细胞显著多于高表达组,嗜酸性粒细胞和中性粒细胞显著低于高表达组(P<0.05),而 UCHL5 低表达组的CD8+T细胞显著高于高表达组(P<0.001),UCHL5 高表达组的肿瘤突变负荷显著高于低表达组(P<0.05).在肝癌HepG2 细胞系中,UCHL5 主要结合在靶标基因的外显子区域,参与RNA剪接调控和应激颗粒的形成.UCHL5 敲降后,多个与肝癌进展相关的靶标基因表达发生显著变化,表明其可能通过调控这些基因促进肝癌细胞的发生发展.结论 本研究揭示了UCHL5在肝癌中的重要作用和潜在机制,强调其作为潜在治疗靶点和免疫治疗疗效预测分子的临床价值.
关键词:肝细胞癌泛素羧基末端水解酶L5下游靶标生物信息学
分类号:R735.7(消化系肿瘤)
资助基金:南京鼓楼医院青年培育项目(2024-LCYJ-PY-59)南京鼓楼医院新技术发展立项项目(XJSFZLX202321)
论文发表日期:2025-04-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 321-327 )
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