结肠腺癌转录因子预后模型的开发与验证
林晨
卢陈嘉
向瑶
深圳市龙华区人民医院病理科,广东 深圳 518110
摘要：目的 构建结肠腺癌(COAD)转录因子(TFs)预后模型,为评估COAD患者的生存风险提供理论依据.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载COAD患者的临床信息及RNA-seq数据,筛选差异表达的TFs,并进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析.采用单因素及多因素Cox比例风险回归模型建立具有预后价值的转录因子模型,通过Kaplan-Meier法分析高、低风险组患者的生存状况,利用受试者工作特征(ROC)曲线评估临床病理参数及风险模型对COAD患者预后的预测效能,并随机抽取 50%样本进行内部验证.采用单因素与多因素Cox回归分析验证年龄、性别、TNM分期、T分期、N分期及风险评分是否为独立预后因素,并基于多因素Cox回归分析构建包含临床病理参数和风险评分的列线图模型.结果 共鉴定出 131 个差异表达的TFs.通过单因素及多因素Cox回归分析筛选出 3 个TFs(FOXS1、HSF4 和LBX2),均为影响COAD患者预后的危险因素.多因素Cox回归分析显示,高风险组患者风险评分较高,低风险组评分较低,与内部测试组结果一致.高风险组患者的总生存时间(OS)显著短于低风险组(P<0.001),该结果在内部测试组中也得到验证(P<0.001).该风险评分模型在 1 年、3 年、5 年和 10 年生存率的 ROC曲线下面积(AUC)分别为 0.719、0.773、0.773 和 0.694,内部验证组分别为 0.714、0.783、0.783 和 0.668.在 3 年生存率的预测中,该模型与TNM分期、年龄、性别、T分期和N分期的AUC值分别为 0.783、0.278、0.773、0.655、0.627 和 0.639,内部验证组分别为 0.773、0.339、0.657、0.577、0.609 和 0.706.多因素 Cox 回归分析结果显示,风险评分是 COAD 的预后因素(HR=2.160,95%CI:1.370～3.406,P=0.001).基于多因素Cox回归分析构建的列线图预测模型的一致性指数为 0.878.结论 本研究构建并验证的TFs预后风险模型对区分COAD患者高、低风险亚组具有重要临床意义,可为个体化治疗提供参考.
关键词：结肠腺癌转录因子风险评分预后风险模型
分类号：R735.3(消化系肿瘤)
资助基金：深圳市龙华区医学会医学科研专项课题(2023LHMA22)深圳市龙华区医学会医学科研专项课题(2024LHMA24)
论文发表日期：2025-08-28
在线出版日期：2025-10-21（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 785-791 )
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