泌尿生殖道沙眼衣原体MLVA-ompA分型方法的建立及初步应用
覃晓琳
郑和平
薛耀华
黄进梅
吴兴中
曾维英
蓝银苑
欧江丽
1.广东省皮肤病医院,广东广州,5100912.广东省皮肤病医院,广东广州,5100913.广东省皮肤病医院,广东广州,5100914.广东省皮肤病医院,广东广州,5100915.广东省皮肤病医院,广东广州,5100916.广东省皮肤病医院,广东广州,5100917.广东省皮肤病医院,广东广州,5100918.广东省皮肤病医院,广东广州,510091
摘要:目的:探讨泌尿生殖道沙眼衣原体(Ct)多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)-ompA分型方法的建立及初步应用.方法:共对5株Ct参考株和31株性病门诊男性Ct阳性株进行MLVA-ompA分型.合成针对串联重复次数差异性显著的3个可变数目串联重复序列(VNTR)(CT 1291,CT1299,CT 1335)的引物,优化PCR反应条件,进行PCR扩增,与参考序列比对进行MLVA分型.OmpA分型采用本实验室已建立的巢式PCR方法,扩增ompA基因,通过测序后进行Blast比对判断型别.结果:ompA和MLVA分型方法的分辨率分别为0.83和0.86,MLVA-ompA分型分辨率可达0.96.31株临床Ct株中,29例(93.5%)ompA分型成功,共被分为8个基因型B(0.7%)、D(37.9%)、E(0.7%)、F(10.3%)、G(0.7%)、H(0.7%)、J(20.7%)、K(3.4%).31株临床Ct株MLVA分型全部成功(100%),共检出10个MLVA亚型和18个MLVA-ompA亚型.结论:成功建立了Ct的MLVA-ompA分型方法,该方法可对临床Ct阳性株进行分型分析,与ompA分型方法相比,具有更高分辨率,可作为Ct传统分型方法的补充.
关键词:沙眼衣原体PCRMLVAompA
分类号:R374(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
资助基金:广东省医学科研基金(B2013050)广东省自然科学基金(2015A030313895)广东省科技计划(2013B021800169)
论文发表日期:2016-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 231-235 )
英文信息
