白念珠菌Mdr1基因生物信息学分析
何泰龙1
高文超1
孙瑶1
黄家敏1
黄丽林2
张静3
张云青1
李美荣1
尹颂超1
黄怀球1
1.中山大学附属第三医院皮肤科,广东 广州,5106302.广东省妇幼保健院儿科,广东 广州,5100103.中山大学附属第三医院皮肤科,广东 广州510630;中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科,广东 广州510120
摘要：目的:探讨白念珠菌多重耐药基因(Mdr1) DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质.方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Mdr1基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析.结果:Mdr1 DNA中无内含子,Mdr1 mRNA中含有多个调控元件和腺苷酸化位点、AU富集区,对二级结构分析显示,Mdr1 mRNA全长序列可形成棒状结构.蛋白质的理化性质分析显示MDR1蛋白稳定系数为37.14,提示MDR1蛋白较为稳定.TargetP 1.1和SignalP 4.1预测结果显示MDR1蛋白不含有线粒体定位序列和分泌信号肽.SWISS-MODEL 3D建模,MDR1蛋白质的3D结构类似于通道管状形态.Motif Scan分析结果显示,MDR1蛋白第116-557个氨基酸构成主要协同转运蛋白超家族,TMHMM预测在此范围内含有12个跨膜区间,为跨膜蛋白.结论:Mdr1基因的表达可能受其它基因的调控,MDR1蛋白为主要协同转运蛋白超家族成员,其功能域或为潜在的药物靶点.
关键词：白念珠菌Mdr1基因生物信息学
分类号：R519.3(传染病)
资助基金：国家自然科学基金(81371746)广东省科技计划(2013B010404013)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 307-311 )
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