申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析
黄家敏1
李玉哲2
高文超1
吴晓雁1
孙瑶1
黄丽林3
张静4
李美荣1
胡南5
旷翠娥5
刘佳庆6
黄怀球1
1.中山大学附属第三医院皮肤科,广东 广州,5106302.中山大学附属第三医院岭南医院检验科,广东广州,5106303.广东省妇幼保健院儿科,广东 广州,5100104.中山大学附属第三医院皮肤科,广东 广州 510630;中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科,广东广州 5101205.深圳市宝安区人民医院皮肤科,广东 深圳,5181016.中山大学中山医学院,广东 广州,510080
摘要：目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能.方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征.结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸.TargetP和Motif Scan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点.TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽.结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物.
关键词：申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶生物信息学
分类号：R756(皮肤病学与性病学)
资助基金：国家自然科学基金(81371746)国家级大学生创新创业训练计划项目(201601072)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 325-329 )
英文信息