申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析
吴晓雁1
张静2
黄家敏3
孙瑶4
黄晓雯5
高文超1
吴榕1
陈三妹6
黄怀球1
1.中山大学附属第三医院皮肤科,广东广州5106302.中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科,广东 广州5101203.深圳市人民医院皮肤科,广东深圳5180204.安徽医科大学第一附属医院皮肤性病科,安徽合肥2300225.南方医科大学南方医院皮肤科,广东广州5105156.中山大学附属第三医院全科医学,广东 广州510630
摘要：目的:初步预测及分析申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,Ss.)对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因(4Hppd)编码蛋白的结构和生物学功能特征.方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss.4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征.结果:Ss.4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52.0 kD,等电点为5.98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中.其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度.结论:预测Ss.4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考.
关键词：申克孢子丝菌对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因生物信息学分析
分类号：R379(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
资助基金：国家自然科学基金(81974300)国家自然科学基金(81371746)中山大学三大建设超算专项(82000-31143405)
论文发表日期：2020-04-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 79-82,88 )
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