皮肤黑素瘤中囊泡胺转运蛋白1的免疫浸润景观和预后价值的鉴定
洪梓德1
杨斌2
1.南方医科大学第一临床医学院,广东 广州 510515;南方医科大学皮肤病医院,广东 广州 5100912.南方医科大学皮肤病医院,广东 广州 510091
摘要：目的 评估囊泡胺转运蛋白1 (VAT1 )在皮肤黑素瘤(SKCM)中的免疫浸润景观和预后价值.方法 采用基因表达谱交互分析(GEPIA)方法分析VAT1 在SKCM中的mRNA表达,利用人类蛋白图谱(HPA)进行蛋白质水平的验证.通过GEPIA的生存模块评估VAT1 对SKCM患者生存的影响,并利用GSE98394数据集进行验证.从TCGA下载SKCM的数据集,采用单因素Cox分析评估VAT1 与生存率的关系,利用GSE98394数据集进行验证.利用肿瘤免疫评估资源(TIMER)检测SKCM中免疫浸润水平与VAT1 表达以及SKCM累积存活率的相关性.使用CIBERSORT的相关模块进一步探讨VAT1与肿瘤免疫浸润的相关性.结果 在SKCM中,VAT1 的mRNA和蛋白质表达水平较正常人高.生存曲线和单因素Cox分析显示VAT1 表达上调是预后不良的因素.VAT1 的表达水平与SKCM中CD8 +T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平呈负相关(P均＜0. 01 ).此外,VAT1 高表达组与低表达组相比,驻留记忆CD4 +T细胞、活化的记忆CD4 +T细胞、M1 巨噬细胞、驻留肥大细胞、调节性T细胞、活化的NK细胞、浆细胞等免疫细胞组成比例上差异均有统计学意义(P均＜0. 05 ).结论VAT1 是SKCM潜在的预后生物标志物,且与免疫浸润有关.
关键词：皮肤黑素瘤囊泡胺转运蛋白1免疫生物标志物预后
资助基金：国家自然科学基金(81772240)
论文发表日期：2021-10-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 337-342 )
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