皮肤黑色素瘤预后模型的构建:基于TCGA数据库的铁死亡相关基因
廖景龙
罗涵深
霍博
华中科技大学同济医学院附属同济医院,湖北 武汉 430000
摘要：目的 基于TCGA数据库构建皮肤黑色素瘤铁死亡相关预后模型,揭示铁死亡与皮肤黑色素瘤预后之间的关系.方法 从KEGG数据库中获取铁死亡相关基因,从TCGA数据库中获取皮肤黑色素瘤的样本数据,采用R包从TCGA数据库中获取对应样本的临床信息,单因素Cox回归分析筛选预后相关基因,Lasso回归用于进一步进行变量的选择,基于ggrisk包进行预后模型的构建,survival包及survminer包绘制生存曲线.结果 筛选出12个预后相关铁死亡基因,去掉过度拟合的基因,最终确定7个铁死亡相关基因用作预后模型的构建,包括NOX4、VDAC2、POR、CHMP5、GCH1、CP、ACSL4.生存分析显示高风险组患者生存时间显著短于低风险组(P<0.05).结论 本研究构建的预后模型进一步展示了铁死亡与皮肤黑色素瘤预后密切相关,为皮肤黑色素瘤的治疗和改善预后的研究提供了一个新的方向.
关键词：皮肤黑色素瘤铁死亡相关基因预后模型
论文发表日期：2023-08-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 307-313 )
英文信息