瘢痕疙瘩发病机制中的脂代谢相关基因:基于生物信息学分析和验证
钟依秀1
王琦2
张江林1
1.南方科技大学第一附属医院,南方科技大学医学院,广东 深圳 5180552.南方医科大学南方医院,广东 广州 510515
摘要:目的 基于生物信息学方法探讨瘢痕疙瘩发生发展的脂代谢相关基因.方法 从GEO数据库获取瘢痕疙瘩相关数据集,从Genecards数据库下载脂代谢相关基因,进行交集分析筛选出共同基因;对差异基因进行GO、KEGG富集分析;使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和免疫组化验证显著差异基因.结果 瘢痕疙瘩中脂代谢相关差异基因共有2个共同基因ACSS3和PRKD1,其中ACSS3差异最显著.差异基因的生物过程主要富集在甘油酯生物合成过程和脂肪酸衍生物代谢过程等.KEGG主要富集在甘油酯代谢过程和花生四烯酸代谢过程等.qRT-PCR和免疫组化显示ACSS3在瘢痕疙瘩组织中高表达.结论 ACSS3可能通过影响脂代谢在瘢痕疙瘩发生发展中发挥重要作用.
关键词:瘢痕疙瘩脂代谢ACSS3生物信息学
资助基金:国家自然科学基金(82073019)国家自然科学基金(82073018)国家自然科学基金(82202851)深圳市科技创新委员会项目(JCYJ20210324113001005)深圳市科技创新委员会项目(JCYJ20210324114212035)深圳市科技创新委员会项目(JCYJ20220530151817038)南方科技大学-萱嘉联合工程实验室(Y01411853)广东省基础与应用基础研究基金(2023A1515110487)南方医科大学南方医院院长基金(2021B004)
论文发表日期:2024-05-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 313-318 )
英文信息
