基于生物信息学探讨类泛素化修饰在银屑病中的作用机制并药物敏感性分析
袁立燕
余晓玲
何雪瑜
南方医科大学皮肤病医院,广东 广州 510091
摘要：目的 使用生物信息学方法探讨泛素样修饰蛋白(SUMO)在银屑病中的表达与调控机制,分析其对银屑病代谢相关的影响.方法 通过R语言(3.3.6)绘制SUMO在银屑病和对照组中的差异表达及接收者操作特征曲线(ROC),利用GeneMANIA网站构建SUMO的相互作用网络,采用网络基因富集分析软件(GSVA)展示SUMO在银屑病数据集中的富集通路,采用XGBOOST和随机森林筛选优势基因并在数据集中进行差异表达的验证,使用pRRophetic[R4.2.0]在银屑病数据集寻找可能靶向SUMO的药物.结果 SUMO1、SUMO3、SUMO1P3、SUMO2P3在银屑病皮损中高表达,SUMO在银屑病中与多个代谢通路相互作用,其中SUMO1可证实为与代谢通路相关性最为密切的基因.结论 SUMO mRNA在银屑病皮损中高表达,SUMO1可能通过调控银屑病代谢过程参与银屑病发生发展.
关键词：银屑病类泛素化修饰SUMO代谢
资助基金：国家自然科学基金(82103724)广东省科技计划项目(2022A1515111018)广东省中医药课题(20231109)广州市科技计划项目(202201011412)
论文发表日期：2024-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 842-849 )
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