牛源防御素类抗菌肽的生物信息学分析
张炜
杭柏林
董萌萌
胡斌
徐彦召
张慧辉
胡建和
1.河南科技学院动物科技学院,河南 新乡,4530032.河南科技学院动物科技学院,河南 新乡,4530033.河南科技学院动物科技学院,河南 新乡,4530034.河南科技学院动物科技学院,河南 新乡,4530035.河南科技学院动物科技学院,河南 新乡,4530036.河南科技学院动物科技学院,河南 新乡,4530037.河南科技学院动物科技学院,河南 新乡,453003
摘要：为研究牛源防御素类抗菌肽的生物学功能,本研究利用ProtParam工具分析了抗菌肽的理化性质,利用SOPMA分析了抗菌肽的二级结构,利用NetOGlyc 4.0 Server分析了抗菌肽的糖基化,利用NetPhos 3.1 Server分析了抗菌肽的磷酸化,利用Target P 1.1 Server分析了抗菌肽的亚细胞内定位.结果表明,牛源防御素类抗菌肽为阳离子型抗菌肽,等电点在9.31～11.20之间;TAP、bBD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD7、BNBD8和BNBD9为稳定性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为不稳定多肽;BNBD12和BNBD13为疏水性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为亲水性多肽;TAP、LAP、bBD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD4、BNBD6、BNBD7、BNBD8和BNBD10由α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲构成,EBD、BNBD1、BNBD5、BNBD11、BNBD12和BNBD13由β折叠、β转角和无规则卷曲构成;没有糖基化位点,除了BNBD7不存在磷酸化位点外,其他16种防御素类抗菌肽存在丝氨酸和苏氨酸的磷酸化位点,但不存在酪氨酸的磷酸化位点.根据分析结果推测牛源防御素类抗菌肽可作用于细胞壁或细胞膜,从而导致细菌死亡.
关键词：牛防御素抗菌肽生物信息学
分类号：Q51(蛋白质)
资助基金：国家自然科学基金(31672559)河南省自然科学基金(182300410031)河南省高等学校科技创新团队支持计划(15IRTSTHN)河南科技学院高层次人才启动项目(2014020)
论文发表日期：2018-07-02
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1-9 )
英文信息