金草鱼Serpinc1基因克隆及其序列分析
程一飞1
韦思婷1
王进千1
姜涛1
黄晨1
张丽1
史丽娜2
刘丽霞1
1.西北民族大学生命科学与工程学院,甘肃兰州7300302.定西市渔业技术推广站,甘肃定西743000
摘要：获取金草鱼Serpinc1基因序列,研究金草鱼与草鱼Serpinc1基因的差异,并预测金草鱼Serpinc1基因序列的特征及其编码蛋白的高级结构.本研究利用RT-PCR克隆测序技术获得金草鱼Serpinc1基因序列,分析其与草鱼Serpinc1基因的差异,并通过生物信息学方法预测金草鱼Serpinc1基因序列的特征及其编码蛋白的高级结构.结果 显示,金草鱼Serpinc1基因与草鱼相比共有4个核苷酸位点发生改变(c.1091T＞A、c.1116A＞T、c.1176T＞G和c.1179C＞ T),其中仅有1个位点(c.1091T＞ A)为错义突变,导致第364位缬氨酸(Val)转变为谷氨酸(Glu).生物信息学预测结果表明,金草鱼Serpinc1基因开放阅读框长度为1 353 bp,共编码450个氨基酸,分子量为50.89 kDa,理论等电点为6.58,不稳定指数为34.55,属于不稳定蛋白;编码氨基酸包含20种标准氨基酸,其中亮氨酸最多(10.2％),而色氨酸(Trp)含量最少(1.3％);整条肽链的亲疏水平均值为-0.213,表现为亲水性;包含4个糖基化位点和37个磷酸化位点;蛋白质二、三级结构以α螺旋和无规则卷曲为主.研究结果可为深入研究金草鱼Serpinc1分子结构和功能及其发挥该功能的活性位点的验证奠定了基础,为金草鱼出血性疾病相关分子标记的筛选提供了理论基础.
关键词：金草鱼Serpinc1基因基因克隆序列分析
分类号：S8917.4(养蜂、益虫饲养)
资助基金：中央高校基本科研业务费专项西北民族大学项目(31920190025)创新项目(XBMU-BYL19092)定西市草牧产业科技研发专项(2017)
论文发表日期：2020-04-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 1-7 )
英文信息