绵羊CARTPT基因的生物信息学分析
邵顺成
闫背背
张稳
张天闻
梁鹏
邹诗凡
冯登侦
1.宁夏大学农学院,宁夏银川7500002.宁夏大学农学院,宁夏银川7500003.宁夏大学农学院,宁夏银川7500004.宁夏大学农学院,宁夏银川7500005.宁夏大学农学院,宁夏银川7500006.宁夏大学农学院,宁夏银川7500007.宁夏大学农学院,宁夏银川750000
摘要：试验旨在探究绵羊CARTPT基因所编码蛋白的结构与功能,利用生物信息学软件研究其理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜区域、蛋白质二级结构与三级结构、亚细胞定位和蛋白结构域、糖基化和磷酸化位点,并构建不同物种的CARTPT基因的系统发育树.结果表明:绵羊CARTPT基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量12 790.18 Da,理论等电点8.22,脂肪系数114.48,总平均亲水性-0.006,属于分泌蛋白,没有跨膜区域结构;二级结构中主要以α-螺旋与无规则卷曲为主;亚细胞定位分析预测该蛋白最可能在细胞外基质发挥其生物学作用,有1个跨膜结构域;该蛋白质有5个丝氨酸(Ser)、1个苏氨酸(Thr)、2个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;系统进化树发现绵羊与山羊亲缘关系最近.
关键词：绵羊CARTPT基因生物信息
分类号：S826(家畜)
资助基金：宁夏优质肉羊新品种培育(NXNYYZ20150101)
论文发表日期：2020-11-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 1-5 )
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