一例PPRV阳性羊鼻拭子样本N、P、M、F、H基因的序列测定和遗传进化分析
赵文华1
李富祥1
尹伟2
杨仕标1
1.云南省畜牧兽医科学院云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南昆明 6502242.嵩明县杨桥街道农业综合服务中心,云南杨桥 651705
摘要:为对采集自昆明某大型牲畜交易市场的一例PPRV阳性鼻拭子样本进行追根溯源,设计引物采用RT-PCR方法进行PPRV病毒基因组关键基因N、P、M、F、H核苷酸序列扩增,并进行序列测定和遗传进化分析.结果显示:N、P、M、F、H基因均有预期片段扩增,其读码框(ORF)长度分别为1578、1531、1008、1641及1830 nt;N、P、M、F及H构建的遗传进化树均显示所测毒株为基因IV型,同2013年在新疆伊犁山羊中检测到的毒株(KM091959)同源性最高,N、P、M、F、H核苷酸同源性分别为99.2%、99.0%、99.4%、99.6%和99.3%,推断氨基酸同源性分别为98.7%、98.4%、100.0%、99.8%和99.3%.研究表明,检测到的毒株仍为2013~2014年我国PPRV流行期的基因IV型毒株,变异较小;所测毒株的N、P、M、F、H 5个关键基因中,M基因最保守、其次是F/H基因,而N、P基因略有变异.
关键词:小反刍兽疫病毒普通RT-PCRN、P、M、F、H基因序列测定遗传进化分析基因IV型
分类号:S855.3(动物医学(兽医学))
资助基金:国家自然科学基金(32060809)国家重点研发计划(2017YFD0501801)国家重点研发计划(2017YFD0501805)
论文发表日期:2020-12-15
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 8-13 )
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现代畜牧兽医

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ISSN:1672-9692
年,卷(期):2020,(12)
所属栏目:试验研究