牦牛HMOX1基因克隆及生物信息学分析
张雅欣
张雅洁
李睿思
唐甜
吴贝宁
麻俊渊
杨妍梅
西北民族大学生命科学与工程学院,甘肃兰州730030
摘要：研究旨在克隆牦牛血红素加氧酶1(HMOX1)基因,并对其进行生物信息学分析.采用牦牛肺脏组织为材料,根据NCBI数据库公布的牦牛的HMOX1基因序列,利用primer 5.0软件进行引物设计,通过PCR扩增的方法克隆HMOX1基因CDS区序列,并利用在线软件对其编码蛋白进行理化性质、疏水性、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、二级结构、三级结构、同源性和系统进化树的预测分析.结果显示,牦牛HMOX1基因CDS区包含870个核苷酸,编码289个氨基酸,分子量为32 876.64,理论等电点为6.68;疏水性分析结果显示,该蛋白为亲水性蛋白,存在1个跨膜结构区域,不存在信号肽;亚细胞定位预测可能为胞质蛋白;预测该蛋白有14个丝氨酸磷酸化位点、17个苏氨酸磷酸化位点和11个酪氨酸磷酸化位点;二级结构和三级结构预测以α-螺旋和无规则卷曲为主;同源性分析表明,牦牛与牛的亲缘关系最近.
关键词：牦牛HMOX1基因克隆生物信息学分析
分类号：S823.8+5(家畜)
资助基金：西北民族大学本科生科研创新项目(XB-MU21108)西北民族大学国家级大学生创新创业训练计划项目(202110742052)
论文发表日期：2022-08-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 10-15 )
英文信息