辽宁地区5株H1N1亚型猪流感病毒分子特征与遗传进化分析
魏澍1
兰德松1
张皓淳1
孙世宇1
刘立2
费东亮3
1.辽宁省农业发展服务中心,辽宁 沈阳 1100342.内蒙古赤峰市克什克腾旗农牧局,内蒙古 赤峰 0240003.锦州医科大学实验动物中心,辽宁 锦州 121001
摘要:研究旨在了解辽宁地区猪群中猪流感病毒(SIV)的分子特征及遗传进化规律,探究其特异性分子靶标,为猪流感的防控提供参考.试验收集辽宁不同地区分离到的5株SIV,对其进行全基因组测序分析.利用DNAStar、MEGA6.0等软件对测序基因片段进行开放阅读框(ORF)核苷酸同源性分析,并构建遗传系统进化树.结果显示,5个分离株属于类禽型H1N1 SIV株,各基因同源性分别为HA 95.4%~99.7%、NA 97.3%~99.8%、M 92.6%~99.8%、NP 97.3%~99.1%、NS 96.1%~98.1%、PA 97.7%~99.3%、PB197.1%~99.8%和PB296.8%~99.2%.在8个基因片段中,HA、NA和NS基因均属类禽型H1N1进化分支,PB2、PB1、PA、NP基因属于人H1N1流感进化分支,M基因分属类禽H1N1 SIV分支和人H1N1流感分支,而NS基因属于经典型H1N1 SIV分支.研究表明,流行于辽宁地区SIV毒株中出现不同基因型流感病毒片段之间的重组情况,分离株HA蛋白裂解位点序列为PSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子特征.
关键词:猪流感病毒H1N1亚型序列分析
分类号:S855.3(动物医学(兽医学))
论文发表日期:2023-02-15
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 27-32 )
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